《表3 20对引物的具体信息》

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《基于桑葚转录组测序的SSR位点分析》

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根据转录组测序所获得的基因序列，按照引物的设计原则，共设计了27 149对引物。为了进一步筛选和评价引物的有效性，按照不同类型（单核苷酸，二核苷酸，三核苷酸，四核苷酸，五核苷酸，六核苷酸）的SSR位点基序，随机选择合成20对引物（表3）。使用所有引物对四个桑树品种进行PCR检测，结果表明，在‘安葚’、‘白玉王’、‘丰驰桑’、‘冀桑3号’分别有18对、17对、19对、18对引物扩增出明显条带（图3）；16对引物在四个品种中均扩增成功，表明这些引物在不同的桑树品种间具有较好的通用性。引物P7扩增条带大小约300 bp，与预测长度明显不符；这可能是由于预测产物长度是基于c DNA序列，而扩增模板为DNA，引物P7所扩增模板序列包含一段内含子序列。由于琼脂糖凝胶电泳分辨率比较低，故很难分析SSR位点的多态性，本研究中只有引物P5、P8出现明显的多态性条带，需采用如聚丙烯按凝胶电泳或毛细管电泳等高分辨率技术进行下一步的研究。