《表4 烟草mi RNA169启动子区域预测结果》

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《烟草miRNA169基因家族及启动子的生物信息学分析》

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截取上述8组pre-miRNA169序列5’侧翼区2 000 bp的序列作为启动子预测区域，利用启动子在线分析软件Promoter 2.0 Prediction Server、Neural Network Promoter Prediction（截断值0.8）、Softberry(TSSP）进行启动子预测。综合3种软件的预测结果及各miRNA169前体序列的分布位置，推测出烟草miRNA169启动子最有可能存在的位置，结果见表4。其中，Promoter 2.0 Prediction Server只预测到nta-miRNA169s在800 bp处有很高的可能性存在启动子，Softberry(TSSP）对pre-miRNA169在反义链上的启动子预测效果不佳。