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第一章核酸研究历史1

§1.1 核酸研究起源1

§1.2 核酸结构早期研究2

§1.3 DNA结构的发现6

§1.4 分子生物学研究进展9

§1.5 化学与生物学的结合11

§1.6 今后的发展趋势13

第二章核苷、核苷酸和核酸的结构15

§2.1 概述15

§2.2 核苷及核苷酸的物理性质20

2.2.1 离子化21

2.2.2 互变异构23

2.2.3 氢键24

§2.3 核苷及核苷酸的光谱性质26

§2.4 核苷酸的形状27

2.4.1 糖环的折迭28

2.4.2 Syn-anti构象30

§2.5 核酸的结构32

2.5.1 核酸的一级结构32

2.5.2 DNA的二级结构36

2.5.3 RNA二级和三级结构40

第三章核苷的化学合成45

§3.1 概述45

3.1.1 具有抗病毒活性的核苷45

3.1.2 核苷碱基的修饰47

3.1.3 核糖部分的修饰49

3.1.4 磷酸酯部分的修饰54

§3.2 糖苷键的形成56

3.2.1 碱基重金属盐缩合法56

3.2.2 熔融合成法57

3.2.3 季铵离子化法58

3.2.4 碱基三甲基硅基衍生物法59

3.2.5 糖苷键转移法61

3.2.6 端基的立体化学控制63

3.2.7 C-核苷68

§3.3 糖环C-1位碱基形成法69

3.3.1 碱基修饰核苷的合成69

3.3.2 C-核苷71

3.3.3 碳环核苷72

§3.4 非环核苷的合成75

第四章核苷的化学反应76

§4.1 核苷糖部分的反应76

4.1.1 邻近基团反应76

4.1.2 取代和消除反应79

4.1.3 氧化反应81

4.1.4 烷基化反应84

§4.2 核苷碱基部分的反应85

4.2.1 C-X键的形成85

4.2.2 C-O键的形成87

4.2.3 C-S键的形成91

4.2.4 C-N键的形成92

4.2.6 C-C键的形成94

4.2.5 C-H键的形成94

4.2.7 N-C键的形成96

§4.3 包括糖和碱基的反应97

4.3.1 环核苷的形成97

4.3.2 糖苷的转移108

第五章核苷酸的生物合成111

§5.1 嘌呤核苷酸的生物合成112

5.1.1 从头合成途径112

5.1.2 补救合成途径120

§5.2 嘧啶核苷酸的生物合成121

5.2.1 从头合成途径121

5.2.2 补救合成途径125

§5.3 脱氧核糖核苷酸的合成127

§5.4 核苷酸的分解代谢131

§5.5 核苷酸的聚合134

5.5.1 DNA聚合酶134

5.5.2 RNA聚合酶135

§6.1 概述137

第六章糖环修饰核苷类似物的合成137

§6.2 由核苷出发合成2’,3’-双脱氧核苷及其类似物139

6.2.1 双脱氧核苷(包括不饱和类似物)139

6.2.2 取代双脱氧核苷143

6.2.3 氟代双脱氧核苷150

§6.3 双脱氧核苷及其类似物的从头合成153

6.3.1 双脱氧核苷和取代的双脱氧核苷153

6.3.2 碳环核苷类似物161

6.3.3 杂环类似物169

6.3.4 无环双脱氧核苷类似物172

§6.4 Oxetanocin及其类似物175

6.4.1 Oxetanocin及其衍生物175

6.4.2 Oxetanocin的碳环类似物178

第七章核酸的化学合成182

§7.1 简介182

§7.2 核酸合成中的保护基团185

7.2.1 羟基保护基186

7.2.2 氨基保护基191

7.2.3 磷酸部分保护基195

§7.3 寡核苷酸的组建200

7.3.1 核苷磷酸的活化200

7.3.2 磷酸二酯法203

7.3.3 磷酸三酯法205

7.3.4 亚磷酸三酯法209

7.3.5 氢磷酸酯法214

§7.4 固相合成214

7.4.1 固相载体216

7.4.2 固相亚磷酸三酯法218

§7.5 固相合成的检测及方法224

§7.6 多核苷酸的分离纯化229

7.6.1 多核苷酸的分离纯化229

7.6.2 合成多核苷酸结构测定231

第八章反义核酸233

§8.1 反义寡核苷酸的化学改造234

8.1.1 磷酸部分的改造235

8.1.2 核糖部分的改造240

§8.2 反义寡核苷酸的作用机制241

8.1.3 杂环碱基的改造241

8.2.1 抑制翻译机制242

8.2.2 抑制转录机制242

8.2.3 转录后过程抑制机制243

8.2.4 非序列专一性抑制机制243

8.2.5 RNase H机制244

8.2.6 有相互作用基团的反义寡核苷酸作用机制246

8.3.1 反义寡核苷酸透过细胞膜的能力247

§8.3 反义寡核苷酸的性质247

8.3.2 反义寡核苷酸的结合亲和性251

8.3.3 反义寡核苷酸的杂交专一性253

8.3.4 反义寡核苷酸的稳定性254

§8.4 多肽核酸256

8.4.1 多肽核酸的杂交性质257

8.4.2 多肽核酸的分子生物学研究258

8.4.3 多肽核酸的合成与改造259

§8.5 反义寡核苷酸的应用前景260

§8.6 酶性核酸261

8.6.1 酶性核酸的类型263

8.6.2 酶性核酸的改造264

8.6.3 酶性核酸的转运270

8.6.4 酶性核酸的应用前景271

第九章以DNA为靶点的抗癌药物275

§9.1 以基因序列作为靶点276

§9.2 DNA序列具有专一性所必须的条件278

§9.3 DNA序列识别的分子结构方面的要求280

§9.4 以小沟作为靶点283

9.4.1 非共价复合物284

9.4.2 共价复合物292

§9.5 以大沟作为靶点295

§9.6 嵌合及DNA切割试剂298

§9.7 序列专一性和生物活性之间的关系301

参考文献305

缩写307

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