《表1 磺胺类化合物的结构和活性数据》

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《磺胺类蛋白酪氨酸磷酸酶1B抑制剂的分子对接和三维定量构效关系研究》


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注:MW表示相对分子质量;ClogP表示疏水常数;IC50表示半数抑制浓度;pIC50表示半数抑制浓度的负对数值。

为了研究磺胺类化合物与PTP1B的结合模式,本文使用SYBYL-X2.0软件中的Surflex-Dock模块进行对接研究。本文所选的28个磺胺类化合物的结构和活性数据见图1和表1。2VEY的PTP1B复合物晶体的配体小分子结构见图2,其相对分子质量为596.69,磺胺类化合物的平均相对分子质量为601.9,两者的相对分子质量相差5.21。PTP1B与其底物的晶体复合物结构来源于RCSB蛋白质数据库(PDB ID:2VEY)。蛋白复合物晶体的处理采用SYBYL-X 2.0软件的常规的蛋白准备方式,抽出2VEY的PTP1B复合物晶体的配体小分子、无机离子、水分子,并对酶分子进行加氢、加载Gasteiger-Hückel电荷处理。对接计算的其他参数设置为默认值。