《表3 丹霞梧桐16对多态性EST-SSR引物》

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《基于丹霞梧桐转录组数据的EST-SSR标记开发》

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F:正向引物；R:反向引物

为进一步利用基于转录组测序所得的丹霞梧桐EST-SSR引物，对含有SSR位点的unigene序列进行引物设计，共筛选出73对EST-SSR引物（详见http：//doi.org.10.13430/j.cnki.jpgr.20190121001，附表1）（附表1）。以丹霞梧桐16个样本的DNA为模板，进行PCR扩增，以验证这些引物的有效性。2%的琼脂糖凝胶电泳检测结果表明，52对引物可成功扩增，有效扩增率为71.23%；6%的聚丙烯酰胺凝胶电泳结果表明，16对引物具有多态性（表3），多态性概率为30.77%。合成16对荧光引物，进行毛细管电泳检测，各引物目的片段清晰，结果可靠。其中，多态性引物unigene＿21904的毛细管电泳结果见图1，其在样本JH6、JH7中的PCR扩增产物片段大小分别为159 bp、159 bp/163 bp。