《表4 EST-SSR引物扩增结果及多态性信息》

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《广西部分地区野生茶树遗传关系EST-SSR标记分析》


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利用15对EST-SSR引物对31份实验材料进行多态性检测,部分引物扩增结果见图1。如表4所示,共检测到68个等位位点。扩出等位位点数最多的引物为T395和T588,分别可以扩出6个等位位点,其次是T6、T8、T185、T685、T802、T1110,均可扩出5个,T12、T21、T228、T641、T687可扩出4个,T663、T113为3个,T13扩出的等位位点最少,为2个,平均每个引物可扩出的等位位点数为4.47个。在扩增到的68个等位基因中有14个特异等位基因,主要分布在宁明2号、宁明4号、六堡1号和金秀5号中,表明这几个种质在某些位点与其他种质有着很大差异,是研究等位基因功能差异的良好材料。对于整个群体而言,群体的观测杂合度(Ho)变化范围为0.18(T113)~0.63(T1110),平均为0.42;期望杂合度(He)的变化范围为0.23(T113)~0.74(T588),平均为0.55。Shannon信息指数(I)变幅在0.35~1.53之间,平均0.97。多态性信息含量(PIC值)是衡量引物扩增位点多态性的重要指标。当PIC>0.5时,表明扩增位点具高度多态性,0.25