《表1 糖尿病相关靶点及PDB编号》
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《何首乌中二苯乙烯氧苷降血糖靶点筛选及体内外降血糖活性研究》
从蛋白质数据库(www.rcsb.org)依次下载糖尿病相关靶点(表1)的晶体结构,对于没有晶体结构的GPR40和SGLT2,其结构取自文献并分别选择GW9508[7]和达格列净[8-9]作为阳性对照,其他靶点以晶体结构原配体为阳性对照。在Schr?dinger软件中对受体结构用Protein Preparation Wizard模块分别进行加氢、加电荷、去除结晶水等处理,并在Glide模块中以原配体为中心(GPR40和SGLT2以文献报道活性位点残基为中心)生成格点文件;以LigPrep模块进行配体处理,选择Epik方法生成pH值为7±2的所有可能构象。最后,采用Glide模块进行分子对接,精度选为标准精度。
图表编号 | XD0097956500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.28 |
作者 | 史永恒、袁欣、党明、张晓双、刘继平、王斌 |
绘制单位 | 陕西中医药大学药学院、陕西省中医药管理局中药药效机制与物质基础重点研究室、陕西中医药大学药学院、陕西中医药大学药学院、陕西中医药大学药学院、陕西中医药大学药学院、陕西省中医药管理局中药药效机制与物质基础重点研究室、陕西中医药大学药学院、陕西省中医药管理局中药药效机制与物质基础重点研究室 |
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