《表2 S.antibioticus NRRL 8167基因组AntiSMASH(V4.0.2)分析结果》
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《链霉菌Streptomyces antibioticus NRRL 8167中Naphthgeranine A生物合成基因簇的分析鉴定》
S.antibioticus NRRL 8167基因组DNA纯化合格后,委托武汉菲沙基因信息有限公司进行全基因组测序。结果显示:S.antibioticus NRRL 8167基因组含有一条线性染色体,染色体长度为9 379 887 bp,(G+C)mol%含量为71.5%。采用Anti SMASH(V4.0.2)对S.antibioticus NRRL 8167的基因组序列进行分析,发现共含有28个次级代谢物生物合成基因簇,包括3个非核糖体肽合成酶(Nonribosomal peptide synthetase,NRPS)基因簇、2个Ⅰ型聚酮合酶(Type I polyketide synthase,PKS)基因簇、1个Ⅱ型聚酮合酶(Type II polyketide synthase,PKS)基因簇、3个萜类(Terpene)合成基因簇、2个Siderophore合成基因簇、2个Lanthipeptide合成基因簇、1个Butyrolactone合成基因簇、1个Indole合成基因簇、1个Melanin合成基因簇、1个Ectoine合成基因簇、1个Lassopeptide合成基因簇、1个Linardin合成基因簇、1个Bacteriocin合成基因簇、6个杂合基因簇、2个其他类型代谢物合成基因簇。详细信息见表2。
图表编号 | XD0095868000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.20 |
作者 | 刘洋、王晓政、黄婷婷、周子画、林双君 |
绘制单位 | 上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室、上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室、上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室、上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室、上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室 |
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