《表5 lncRNA的分类》

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《利福平和甲基磺酸甲酯对感染植原体毛泡桐中长链非编码RNA变化的影响》

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每个样品的预测结果如表4所示。在PT、PTI、PTI-M60以及PTI-L100样品中分别鉴定出2 657、2 270、2 378、2 231个候选lncRNAs，以及12 666、13 299、13 414、13 435个新基因。将单个样品的候选lncRNA和新基因预测结果分别用cuffmerge整合到一起，根据其与参考基因在基因组上的位置关系进行分类，挑选出标识符为（i、j、x、u、o）的转录本，共获得3 700个侯选lncRNAs和15 062个新基因。其中有3 030个属于基因间区的“u”类，占总lncRNA的81.89%，表明大部分lncRNAs属于基因间区的lncRNAs（表5）。