《表1 寨卡病毒NS5蛋白结构生物学研究进展》

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《寨卡病毒非结构蛋白NS5的结构与功能研究进展》


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国内外已有多个课题组针对寨卡病毒NS5蛋白的结构进行了研究,其NS5全蛋白、MTase和RdRp结构域的晶体结构先后被解析(表1),极大地促进了相关领域的发展.Li课题组[13]于2017年3月首次发表了寨卡病毒MR766株全长NS5蛋白与S-腺苷-L-高半胱氨酸(SAH)结合复合物的3.0?分辨率结构(图1(b)).如图1(b)所示MTase结构域位于RdRp结构域上方,两者间的包埋面积约1600?2[13].寨卡病毒NS5-MTase连接至RdRp的手指亚结构域,且主要位于RdRp的NTP模板通道上方.两者间的相互作用是通过MTase结构域C端延伸区(Pro113,Leu115,Gln117和Trp121)以及RdRp结构域的食指、无名指和中指结构域(Tyr350,Arg354,Phe466和Pro584)介导的[13,14].Song课题组[14]研究发现,寨卡病毒MR766株NS5蛋白结构中的MTase和单独的MTase结构域基本一致(242Cα原子的均方差偏根为0.42?),表明MTase和RdRp结构域的相互作用并不导致MTase结构的变化.此外,研究人员还发现,寨卡病毒与日本脑炎病毒、登革3型病毒的NS5蛋白序列同源性分别约为68%和66%.其中寨卡病毒与日本脑炎病毒的NS5蛋白的晶体结构高度相似(872Cα原子的均方差偏根为0.63?),且两种病毒NS5-MTase和RdRp结构域间相互作用是由上述同一组范德华力介导的[14].寨卡病毒与日本脑炎病毒NS5蛋白之间的细微结构差异主要表现在MTase结构域的N端和C端延伸区、MTase和RdRp结构域间的连接区以及RdRp手掌亚结构域的一段.已有研究报道,这些区域与NS5蛋白介导的免疫抑制相关[16].结构的差异可能是导致寨卡病毒和日本脑炎病毒NS5蛋白拮抗I型干扰素机制不同的关键原因.相比之下,寨卡病毒和登革3型病毒的NS5蛋白晶体结构差异较大(844 Cα原子的均方差偏根为6.06?),这是由于MTase和RdRp结构域间的相对取向造成的差异[14].