《表1 马流感H3N8引物探针序列》

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《马流感H3N8实时荧光RT-PCR检测方法的建立》


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从NCBI上下载马源宿主H3N8亚型流感HA和NA基因序列,分离地点包括中国、日本、中国香港、印度等地。应用Lasergene软件分别比对HA和NA基因序列的保守区域和SNP特性,使用在线网站weblogo3对引物及探针进行特殊结构分析,NCBI BLAST进行比对最终确定引物及探针。所设计出的H3N8引物探针特异性检测马流感H3N8亚型,而对其他亚型无检出。本研究中所确定的马流感H3N8引物探针序列信息见表1。