《表1 正交试验设计的直观分析》

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《大赖草SRAP-PCR反应体系的建立与优化》


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对电泳条带进行统计(图3),具体方法参照任小巍等(2012)的进行,对16个组合正交试验结果进行分析(表1)。K的平均值大小反映了该因素在不同的水平对PCR体系的影响情况,越大其对应的因素水平扩增效果越好;R表示同一因素在不同水平之间的极差值。值越大,该因素对体系的影响越大(任小巍等,2012)。从R值可以看出(表1),对该体系影响最大的是Mg2+,其极差值为3.25,DNA模板极差值为1.75,d NTPS和引物的极差值为2.25,Taq DNA聚合酶极差值最小,为1.25。Mg2+:水平3好;引物:水平3好;DNA:水平4好;d NTPs:水平2好及Taq DNA聚合酶:水平3好(表1)。因此,综合分析表明组合3的条带清晰、扩增效果好,组合3定为大赖草SRAP-PCR的最佳反应体系。即在25μL体系中,DNA模板为20ng/μL、d NTPs为0.16 mmol/L、Taq DNA聚合酶为1.0 U、Mg2+为2 mmol/L、引物为0.4μmol/L。