《Table 4 Nei's genetic identity and genetic distance of‘Candidatus Liberibacter asiaticus’from

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《基于原噬菌体类型的我国柑橘黄龙病菌种群遗传结构分析》

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我国南方不同地区CLas种群结构通过遗传多样性指数（Nei's diversity index，H value）以及遗传距离（Genetic distance）进行分析。如表3所示，我国整个南方地区的CLas种群遗传多样性指数为0.4118，海南的CLas种群具有最高的遗传多样性指数（0.4777），其次为湖南（0.4600）、浙江（0.4529）、云南（0.4447）、广东（0.2500）、广西（0.2331）、江西（0.2331）、和福建（0.1491）。遗传结构分析表明，广东、广西、福建、浙江、江西、湖南地区的CLas种群具有>0.90的遗传相似性和<0.1的遗传距离（表4）。而云南地区的CLas种群与除海南外的其他省份的CLas种群表现出较低的遗传相似性（0.3208～0.8764）和较远的遗传距离（0.1403～0.7255）。基于遗传距离构建的系统树图显示，我国南方地区的CLas种群可以分为3个组，分别为I组（广东、江西、广西和福建，遗传距离<0.01），II组（浙江和湖南，遗传距离=0.0007）以及III组（云南和海南，遗传距离=0.0614）（图3） ，其中I组和II组又可聚为一大组。I组和II组的CLas种群主要以只携带Type 2类型原噬菌体的菌株（>50%）为主，但II组（浙江和湖南）的CLas种群仍具有超过10%的菌株携带Type 1+Type 3类型原噬菌体的菌株（表2）。而III组（云南和海南）的CLas种群则以Type 1、Type 2和Type 1+Type 3类型的菌株为主。