《表3 葡萄SAP家族亚细胞定位预测》

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《葡萄SAP家族的鉴定与表达分析》

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从葡萄基因组和NCBI数据库中共鉴定出15个SAP家族基因，根据其保守结构域和在染色体上的位置，依次命名为Vv SAP1-VvS AP15。15个VvS APs（图1）分别位于第1、2、6、7、8、13、14、16和18条染色体上，其中VvSAP5、VvSAP6和VvSAP14位于第8条染色体，第2、6、13和16条染色体分别分布在两个VvSAP。结果（表2）显示，葡萄SAP家族基因编码区长度为330—882 bp，编码109—293个氨基酸，等电点为7.99—9.68，均为碱性蛋白。氨基酸序列的平均亲水系数在-0.300—-0.904，均为负值，表明这些蛋白均为亲水蛋白，但亲水程度不同。对VvSAP家族基因进行亚细胞定位预测，结果显示（表3）它们都存在于细胞核中，大部分存在于叶绿体和细胞骨架中，初步推测该家族主要存在于进行光合作用的器官中，并参与了细胞壁的形成。其中，只有VvSAP14和VvSAP15不存在于叶绿体和细胞骨架，VvSAP9、VvSAP10还定位于过氧化物酶体和细胞质中。通过二级结构预测表明（表4），VvSAP二级结构以无规则卷曲和α-螺旋结构为主，拓展链结构和β-转角结构所占比例较小，其中VvSAP9、VvSAP14和VvSAP15的无规则卷曲结构所占比例最大，分别为60.13%、62.12%和73.02%；VvSAP1、VvSAP3和VvS AP10的α-螺旋结构所占比例最大，分别为为30.26%、31.4%和34.87%。