《表1 苓桂术甘汤中小分子化合物的化学信息》

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《分子对接虚拟筛选苓桂术甘汤中NF-κB抑制剂》


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从传统中药数据库TCMSP数据库中寻找苓桂术甘汤中4味中药茯苓、桂枝、白术和甘草相关活性化合物,根据成药性原则,选取同时满足口服生物利用度(Oral Bioavailability,OB)≥30%、类药性(Drug-Likeness,DL)≥0.18、相对分子量M<500、半衰期(Half Life,HF)≥4h的71个化学成分作为候选成分[10](见表1)。从PubChem化合物数据库(http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)下载71个小分子化学成分的3D结构,并通过ChemDraw软件转化成mol格式后,在MOE软件中对每个分子进行加氢处理及Minimize能量优化后,采用Flexible Alignment将其转化成柔性分子,用于对接。