《表3 活性化合物信息:分子对接结合网络药理学研究桂枝芍药知母汤治疗类风湿关节炎的分子作用机制》

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《分子对接结合网络药理学研究桂枝芍药知母汤治疗类风湿关节炎的分子作用机制》


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根据分子对接结果,保留Docking评分高于靶点晶体的原型配体评分的化合物并将其视为GSZD的可能活性分子。最终共得到1 867个分子-靶点数据对,其中包括316个化合物(桂枝34个、白芍17个、知母33个、甘草43个、麻黄40个、生姜30个、白术53个、防风29个、附子37个),26个蛋白靶点。将数据对导入Cytoscape软件中,得到药物-成分-靶点的网络图,结果见图1。所有蛋白信息见表2,化合物信息见表3(表3仅列出degree≥10的活性化合物)。图1中圆形节点代表化合物,菱形节点代表药物,三角形节点代表的是蛋白靶点,节点的大小和颜色深浅表示度的大小。通过分析发现GSZD的活性成分主要作用ZADH2、P38、AKR1C2、DHODH、CA2、MMP3、MMP9、RANKL等靶点,部分对接结果见图2(仅选取degree≥180的靶点及其中docking评分最高的化合物),对接分数最高的小分子化合物几乎完全包裹于活性口袋中。同时可以看出同一个成分可以作用多个靶点,提示GSZD可以通过多成分,多靶点来实现改善RA患者病情。