《表3 内参基因表达稳定性综合排序》
利用ΔCT法和qbase+、NormFinder、BestKeeper 3个软件对候选内参基因在9个不同阶段颗粒细胞中的表达稳定性进行分析,结果如图4所示。ΔCT法是通过计算各基因的平均标准偏差(s)来确定内参基因的稳定性,平均标准偏差越小,基因稳定性越高,故最稳定的内参基因为HMBS。qbase+(geNorm)可计算各候选内参基因的表达稳定值(M),M越小,基因稳定性越高。NormFinder与geNorm程序相似,也是根据内参基因表达稳定值(M)大小来判断内参基因的稳定性。根据M值越小,表达越稳定的原则,qbase+和NormFinder 2种方法得到的最稳定内参基因均为SDH。BestKeeper通过计算每个基因之间产生配对的相关系数(r),以标准偏差(s)和变异系数(CV)来判断基因表达的稳定性,相关系数越大,s和CV的值越小,表明基因表达越稳定,当s>1时,则该内参基因表达不稳定,故最稳定的内参基因为18S。用4种方法对内参基因稳定性进行分析所得到的结果不尽相同,因此需要对4种方法得到的结果进行综合排序。对每一个内参基因采用4种方法所得到的排名取几何均数,得到最终的排名,结果见表3。在不同阶段颗粒细胞中,最稳定的3个内参基因依次为SDH、HMBS、18S,而稳定性最差的3个内参基因为UBC、GAPDH、TUB。
图表编号 | XD0084310200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.25 |
作者 | 莫远亮、王郁石、王继文 |
绘制单位 | 四川农业大学动物科技学院、畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室、四川农业大学动物科技学院、畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室、四川农业大学动物科技学院、畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室 |
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