《表4 PEDV YZ2016一致性分析》

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《猪流行性腹泻病毒YZ2016全基因组测序与稳定性分析》

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左下方:全基因组核苷酸一致性比对；右上方:S蛋白核苷酸一致性比对。

选取国内外24株PEDV分离株，分别与PEDV YZ2016全基因组序列及其S基因所推导的氨基酸序列进行一致性比对（表4）。PEDV YZ2016全基因组序列与参考株的核苷酸一致性为96.5%～99.2%（表4左下方），其中与欧美毒株一致性为96.7%～99.0%，与亚洲毒株一致性为96.5%～99.2%。此外PEDV YZ2016与中国流行毒株BJ-2011-1、LZW一致性最高，可达99.2%；与韩国疫苗株SM98、中国早期分离株LZC一致性最低，仅96.5%。基于S基因推导的氨基酸的一致性分析显示（表4右上方），PEDV YZ2016与中国近年流行株的氨基酸一致性为97.6%～98.5%，与中国早期分离株LZC、JS2008的一致性较低，分别为92.2%、93.1%。其次，其与欧美国家及亚洲其他国家分离株的氨基酸一致性为92.0%～98.5%，其中与疫苗株CV777、SM98的一致性最低，为92.0%；与日本分离株OKN-1/JPN/2013氨基酸一致性最高，达98.5%。