《表2 AutoDock Vina计算中4个靶点的参数设置及相应结果》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《基于分子对接技术石菖蒲中抗抑郁活性成分的筛选》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

采用的分子对接软件为斯克利普斯研究所Olson课题组开发的AutoDock Vina，进行半柔性分子对接计算。AutoDock Vina采用复杂的梯度优化算法来加快局域极小化的过程，并采用了多线程技术，相比AutoDock 4在速度上提升了约2个数量级且精度更好[9]。半柔性对接指的是对接中小分子配体的构象是柔性，可以发生改变，而受体蛋白则是刚性，不发生变化。以靶点蛋白原配体作为中心设置格点，设置的中心坐标以及盒子大小见表2。