《表1 本研究中使用的菌株序列》

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《四川成都南天竹炭疽病病原菌的初步鉴定》


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注:*指模式菌株;★指测试菌株;其余为参考菌株;—指序列未获得。

利用真菌基因组DNA抽提试剂盒提取病原菌的DNA,以ITS、ACT、GAPDH、CHS-1、TUB2和CAL为引物(Weir et al.,2012)对提取到的DNA进行PCR扩增。PCR扩增条件参考李沛利等(2017)的报道。得到测序结果后放入GenBank进行比对,结合测序峰图进行手动修改。下载相似性高的序列和对应种模式菌的序列(表1),使用ClustalX软件进行剪切,按ITS、ACT、GAPDH、CHS-1、TUB2和CAL的顺序依次连接,选取甘薯黑痣病菌(Monilochaetes infuscans)为外群,利用PAUP v4.0b10软件,用最大简约法(MP)进行系统发育树的构建(符丹丹,2014)。