《表1 本研究中使用的菌株序列》
注:*指模式菌株;★指测试菌株;其余为参考菌株;—指序列未获得。
利用真菌基因组DNA抽提试剂盒提取病原菌的DNA,以ITS、ACT、GAPDH、CHS-1、TUB2和CAL为引物(Weir et al.,2012)对提取到的DNA进行PCR扩增。PCR扩增条件参考李沛利等(2017)的报道。得到测序结果后放入GenBank进行比对,结合测序峰图进行手动修改。下载相似性高的序列和对应种模式菌的序列(表1),使用ClustalX软件进行剪切,按ITS、ACT、GAPDH、CHS-1、TUB2和CAL的顺序依次连接,选取甘薯黑痣病菌(Monilochaetes infuscans)为外群,利用PAUP v4.0b10软件,用最大简约法(MP)进行系统发育树的构建(符丹丹,2014)。
图表编号 | XD0081730000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.25 |
作者 | 王彤彤、高粉、刘丹、李沛利 |
绘制单位 | 四川农业大学农学院四川省作物重大病害实验室作物科学国家级实验教学示范中心、四川农业大学农学院四川省作物重大病害实验室作物科学国家级实验教学示范中心、四川农业大学农学院四川省作物重大病害实验室作物科学国家级实验教学示范中心、四川农业大学农学院四川省作物重大病害实验室作物科学国家级实验教学示范中心 |
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