《表1 符合纳入条件的上调及下调表达的前10位circRNA》
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《原发性骨性关节炎膝关节软骨细胞差异表达circRNA、miRNA筛选和生物学功能及其相互作用分析》
共筛选出1 380个表达差异的circRNA,与正常对照膝关节软骨细胞比较,OA膝关节软骨细胞上调表达的circRNA 215个,其中差异倍数5倍以上的有18个;下调表达CircRNA 1 165个,其中差异倍数5倍以上的有45个;大于60个miRNA结合位点的circRNA共有383个,其中上调表达10个,下调表达373个。符合上述条件的上调及下调表达的前10位circRNA见表1。分子功能层面,差异表达的circRNA主要影响GTP酶激活剂活性(GO:0005096)、腺苷核糖核苷酸结合(GO:0032559)、钙通道调节剂活性(GO:0005246);细胞组成层面,主要与细胞外基质成分(GO:0044420)、带状胶原纤维(GO:0098643)、纤维状胶原蛋白三聚体(GO:0005583);生物学过程层面,主要影响细胞成分形态发生(GO:0032989)、软骨细胞发育(GO:0002063)和肢体发育(GO:0060173)。差异表达的circRNA经KEGG通路分析,共得出1 127条通路,按富集程度最有意义的通路与糖原生物合成(来自Biocyc数据库)、补体和凝血级联(来自KEGG路径数据库)、PDGF信号途径(来自Panther数据库)、胶原纤维组装和其他多聚体结构(来自Reactome数据库)有关。
图表编号 | XD0073855800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.25 |
作者 | 王莹、郭雄、王民、杨益民、任志伟、尹思 |
绘制单位 | 西安交通大学第一附属医院、西安交通大学第一附属医院、西安交通大学第一附属医院、西安交通大学第一附属医院、西安交通大学第一附属医院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |