《表1 HeLa细胞中上调或下调前10位差异表达基因》
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《宫颈癌中卵泡抑素样蛋白过表达对下游基因的影响及生物信息学分析》
Notes:FDR:false discovery rate;FOS:AP-1 transcription factor subunit;EGR1:early growth response 1;CTGF:connective tissue growth factor;PDZD2:PDZ domain containing 2;ZFP36:zinc finger protein 36;ATF3:activating transcription factor3;NR4A1:nuclear receptor
按照表达差异倍数(Fold change)≥2和显著差异水平进行校正(FDR)<0.05的筛选条件,对实验组和对照组两组样本的基因进行数据的聚类分析。其中,每一列代表一个样本,每一行代表一个差异基因;红色表示基因的表达程度相对上调,绿色表示基因的表达程度相对下调,黑色表示基因的表达没有显著变化,见图1。结果显示,与对照组相比,实验组有593个基因表达上调,288个基因表达下调。其中上调最明显的为FOS和EGR1,另外下调最明显的为DAW1和GKN2,见表1。
图表编号 | XD0048381500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.25 |
作者 | 张红、洛若愚、胡晓霞、陈欢、王琳琳 |
绘制单位 | 武汉大学人民医院妇科、广西壮族自治区人民医院妇科、武汉大学人民医院妇科、广西壮族自治区人民医院妇科、武汉大学人民医院妇科、广西壮族自治区人民医院妇科 |
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