《表3 实验组鸭十二指肠黏膜组织中Top10位上调/下调基因》

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《鸭肠炎病毒感染对鸭肠道黏膜组织转录组变化分析》

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以FDR<0.001且|FC|≥2作为筛选标准，筛选CK与T24、T48之间的差异表达基因，差异表达基因分别有221、499个。T24有58个基因上调表达，163个基因下调表达；T48有77个基因上调表达，422个基因下调表达（表2）。二者共同拥有82个差异表达基因，都与炎症、免疫、防御反应相关。对T24和T48差异倍数Top10差异基因进行功能注释（表3）。T24的Top10差异基因5上调表达，5个下调表达，4个没有具体的基因名；T48的Top10差异基因5上调表达，5个下调表达，3个没有具体的基因名。本研究将T24和T48与对照组再进行比较，寻找攻毒后免疫差异表达基因。T24的免疫相关差异基因为：LOC101-791569、MMP9、LOC101800358、CHRNA4、ZBTB16、FST，结合疫相关基因作蛋白网络图（图1A）。T48的免疫相关差异基因23个，根据蛋白网络图得到关联性高的免疫基因分别是：TLR1-A、RHOH、SYK、TLR7、TLR4、SPI1（图1B）。