《表1 配体分子及配体分子的可旋转键》

《表1 配体分子及配体分子的可旋转键》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于分子对接技术的黄芩提取物包合作用研究》


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用AutoDockTools软件准备受体(环糊精及衍生物)与配体(黄芩苷、黄芩素、汉黄芩苷、汉黄芩素)的坐标文件,添加H原子与原子电荷,并设置配体分子内可旋转单键数量及根原子(表1)。分别保存为pdbqt格式文件(扩展pdb格式,用于存储坐标、电荷及原子类型等信息)。在分子对接过程中,均以受体几何中心为对接盒子的中心点,盒子尺寸、对接参数均使用默认值,搜索参数选用遗传算法,对接方法采用刚性对接,对接100次。