《表1 配体分子及配体分子的可旋转键》
用AutoDockTools软件准备受体(环糊精及衍生物)与配体(黄芩苷、黄芩素、汉黄芩苷、汉黄芩素)的坐标文件,添加H原子与原子电荷,并设置配体分子内可旋转单键数量及根原子(表1)。分别保存为pdbqt格式文件(扩展pdb格式,用于存储坐标、电荷及原子类型等信息)。在分子对接过程中,均以受体几何中心为对接盒子的中心点,盒子尺寸、对接参数均使用默认值,搜索参数选用遗传算法,对接方法采用刚性对接,对接100次。
图表编号 | XD007029800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.04.05 |
作者 | 雷奇林、苏青、凌保东、曹祥菊、潘映桥、杨逍、刘洁 |
绘制单位 | 成都医学院药学院、成都医学院药学院、四川省高校结构特异性小分子药物重点实验室、成都医学院药学院、四川省高校结构特异性小分子药物重点实验室、成都医学院药学院、成都医学院药学院、成都医学院药学院、成都医学院药学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |