《表3 十字花科植物TERT启动子顺式作用元件分析》

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《AtTERT启动子结构特征及其对拟南芥非生物胁迫抗性的影响》

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+:预测的启动子序列中有该顺式元件；—:预测的启动子序列中无该元件

为充分地了解拟南芥所在科，即十字花科不同物种TERT基因启动子结构特征及图通物种间同源关系，对NCBI及PHYTOZOME数据库上可以搜索到的所有TERT基因启动子进行了聚类分析，共搜索到TERT基因启动子拟南芥属（Arabidopsis thaliana （L.）Heynh.、Arabidopsis halleri（L.）O′Kane&Al-Shehbaz及Arabidopsis lyrata（L.）O′Kane&Al-Shehbaz subsp.lyrata） 3条；亚麻芥属（Camelina sativa （L.）Crantz LOC104705979/LOC104735722） 2条；荠属（Capsella rubella Reut.和Capsella grandiflora Boiss.）2条；芸苔属（Brassica napus L.、Brassica oleracea var.capitata L.及Brassica rapa L.turnip mustard/field mustard）4条；山萮菜属（Eutrema salsugineum （Pall.）Al-Shehbaz&S.I.Warwick） 及Boechera.L ve&D.L ve属（Boechera stricta （Graham Al-Shehbaz）） 各1条，总共13条进行分析。利用BDGP、Phytozome和NEW PLACE以及Methprimer 2.0在线网站对TERT启动子序列分别对转录起始位点、启动子基本元件（TATA-box和CAAT-box等）、非生物胁迫相关顺式作用元件（DRE/CRT元件、MYC、GT1GMSCAM4、HSE、MBS、ABRE、LTR）以及CpG岛的数量进行预测（表3）。结果显示，选取的序列（除Arabidopsis halleri （L.）O′Kane&Al-Shehbaz） 均包含TERT基因的启动子必要元件，响应干旱、高盐或低温及激素应答的非生物胁迫顺式作用元件，而不含有热激元件HSE（ATAAATGT）。将筛选出的序列用Phylogeny（Bootstrap=1000）构建TERT启动子系统进化树（图3）。结果表明，TERT启动子主要有2个遗传分支，其中芸苔属单独位于系统发生树的一进化支上，该属各物种间具有高度保守性，同源性保持97%以上；其余各属同位于系统发生树的另一进化枝上，每属的各个物种间及不同属之间仍然保持较高的同源性，拟南芥At TERT启动子与同属的鼠耳芥（Arabidopsis halleri （L.）O′Kane&Al-Shehbaz） 及玉山筷子芥（Arabidopsis lyrata （L.）O′Kane&Al-Shehbaz subsp.lyrata） 亲缘关系最近，其次是山萮菜属，而与Boechera.L ve&D.L ve属、亚麻芥属、荠属相对较远。从整个系统进化树上看，TERT启动子在十字花科不同种植物间具有较高保守性。