《表2 引物信息:恩施地区烟草病毒病的电镜诊断与RT-PCR鉴定》

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《恩施地区烟草病毒病的电镜诊断与RT-PCR鉴定》


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注:B=C,T,G;K=G,T;R=A,G;S=C,G;V=A,C,G;W=A,T;Y=C,T

使用植物RNA提取试剂盒(Plant Genomic RNA Kit)提取病样总RNA。通过电镜观察到的病毒粒子形态初步获得待测样品病毒种类(1.2.2),根据NCBI已经报道的病毒序列,利用Primer5.0设计特异性目的基因扩增引物。使用马铃薯Y病毒属通用引物用于检测样品中可能存在的马铃薯Y病毒属病毒。所有引物信息与扩增程序如表2所示。扩增产物经凝胶电泳检测,回收纯化目的条带,将回收产物链接到p EASY-Blunt载体上。待克隆检测为阳性重组质粒后,委托上海生工进行测序。测序结果利用BLAST程序与NCBI相关病毒基因数据库比对,分析其同源性[9]。