《表8 FGF处理组, Pathways显著性富集数据表》

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《MT和FGF5调控辽宁绒山羊绒毛生长相关LncRNA的筛选及鉴定》


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样本编号:已注释到该条通路中,同时在表达水平上有统计学意义的基因总数;背景编号:该条通路中所有的基因数Sample number:The number of comment the differentially expressed genes in this pathway;Background number:The number of all genes in this pathway

M2_72H组Lc RNA靶基因富集的NF-κB信号通路中靶基因TNFα、TNFAIP3(A20)、NFKBIA(IkBα)、NFKB2、IL8所对应的LncRNA有两个,分别为(Gene ID):XLOC_005914;XLOC_018763。F4_72H组靶基因富集的Metabolic信号通路中靶基因所对应的Lnc RNA有4个,分别为(Gene ID):XLOC_011424、XLOC_009522、XLOC_009063、XLOC_01115。通过Real-time PCR对筛选出的6个Lnc RNA进行验证,结果如图7所示,MT作用相关的两个LncRNA在RNA-Seq中的表达量上调,Real-time PCR检测结果与RNA-Seq测序结果一致,进一步验证了RNA-Seq测序结果的准确性。FGF5处理辽宁绒山羊皮肤成纤维细胞后,Real-time PCR结果为LncRNA XLOC_011424和XLOC_011157表达量下调;LncRNAXLOC_009063表达量上调;LncRNA XLOC_009522表达量无显著性差异。结合RNA-Seq测序中4个LncRNA表达量均下调的结果,表明LncRNA XLOC_011424、Lnc RNAXLOC_011157与前期结果一致。