《表2 9 6 孔板单次检测81个样品的板布局Tab 2Single‐test panel layout of 81 samples with 96 holes》

《表2 9 6 孔板单次检测81个样品的板布局Tab 2Single‐test panel layout of 81 samples with 96 holes》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于高通量测序的2型糖尿病易感基因靶向测序panel设计及临床应用》


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3.针对易感基因检测panel的多重PCR设计:利用已知位点的RS号查询到SNP上下游序列,针对各个位点分别设计引物,通过NCBI的primer‐blast功能进行引物设计,片段大小范围190~210 bp,退火温度58℃~60℃,共得到针对21个位点的21对引物。利用MP primer在线软件评估多重PCR引物的特异性。每对上游与下游引物的5’端添加9组长度为10 bp的barcode序列用来分样,得到F1~F9组上游引物池及R1~R9组下游引物池,可同时在1个PCR的反应中对81个样品的21个位点进行扩增及后续的文库构建。将上述21对引物均稀释至10μmol/L后,分别将上游与下游引物混合,取10μl,得到9个上游引物池210μl及9个下游引物池210μl。首先配制PCR反应体系(50μl),DNA模板2μl(<1000 ng);Q5 High‐Fidelity 2×MasterMix 25μl(NEB),上游引物2.5μl(10μmol/L),下游引物2.5μl(10μmol/L),去离子三蒸水18μl。其次设置PCR扩增参数设置,98℃预变性30 s,98℃变性10 s,退火30 s,72℃延伸30 s,35个循环。最后72℃延伸2 min,恢复至4℃。将多重PCR扩增产物采用2%琼脂糖凝胶电泳(150 V,30 min),通过紫外分析仪检测有清晰的目的条带后,将多重PCR产物进行纯化(德国耶拿PCR纯化试剂盒)及浓度测定。 (表2)