《表3 分子动力学模拟DNA和STAT3-Y2P-DNA残基之间氢键的比例 (>30%)》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《天然药物牛蒡苷元直接靶向STAT3抑制三阴性乳腺癌的分子对接及分子动力学研究》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

注:在动态系统，氢键距离和角度的界限分别为3.5和120°。氢键占有率的百分比认定为分子动力学模拟期间形成的氢键。此外，在供体和受体的重原子之间测量每个氢键的距离。

以上结果表明Atn在人TNBC细胞中抑制STAT3（Y705）组成性激活。进一步，我们在原子水平上分析了DNA和pSTAT3蛋白质之间的氢结合模式，分析了STAT3或者Y705P与DNA之间的结合氢键（图3H，表3）。在糖基、磷酸基中的碳原子和蛋白质STAT3-b与DNA骨架结合界面的氧原子之间检测到了7个氢键。这些氢键如下:Arg414-1007DT，Thr341-1007DT，Arg423-1006DT，Ser465-1006DT，Arg382-1006DT，Gln469-1005DT和Asn466-1007DT。STAT3-b与DNA五碳糖-磷酸骨架主链的氧原子之间形成特定的氢键。通常情况是，蛋白质残基接受氢键，DNA碱基提供氢键。在STAT3-WT-DNA系统中，STAT3-b和DNA之间形成较少的氢键；与Y705P形成的大量相互作用相比，这些相互作用的占用期通常更长，原因是STAT3-b的DNA结合结构域存在较高迁移率，其允许氢键相互作用的残基（Arg414，Thr341，Arg423，Ser465，Arg382，Gln469和Asn466）迁移，脱离DNA中富含T碱基的沟槽。因此相比Y705P，随着模拟时间的推移，STAT3-b的接口位置变化不大。