《表1 矮牵牛TPS家族成员基本信息》

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《矮牵牛TPS家族基因的鉴定与PhTPS1的表达分析》


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通过将已经公布的辣椒的TPS成员序列在矮牵牛全基因组中进行相似性比对,最终共鉴定得到10个TPS家族成员(表1),其中分布于1(PhTPS1,PhTPS9)、2(PhTPS2,PhTPS6)、7(PhTPS8,PhTPS10)、9(Ph TPS3,PhTPS7)号染色体上的各2个,PhTPS5分布于5号染色体上,PhTPS4未能定位。利用PFAM工具进行蛋白结构域分析,10个矮牵牛TPS均含有TPS(Glyco_transf_20)和TPP(Trehalose_PPase)结构域(Li et al.,2011)。通过对10个PhTPS基因编码蛋白质进行分析,发现其长度范围从833(PhTPS10)~950(PhTPS2)个氨基酸,分子量从94.21 k D(PhTPS9)到107.95 kD(PhTPS2),等电点从5.49(PhTPS7)到6.11(PhTPS2)。