《表1 植物Bowman-Birk基因的基本信息》

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《植物Bowman-Birk蛋白酶抑制剂家族的基因组学分析》


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利用HMMER程序在本地搜索大豆等16种植物的全基因组蛋白序列,将得到的候选序列用SMART和Pfam在线工具预测保守结构域,把不含有Bowman-Birk结构域的序列剔除。最终共获得91个Bowman-Birk基因,其中包括:水稻10个、苜蓿7个、玉米6个、二穗短柄草6个、大豆13个、高粱4个、蓝花耧3个、凤梨3个、芭蕉3个、复原草1个、束草3个、柳枝稷9个、芸豆3个、小米10个、狗尾草9个以及三叶草1个(表1)。