《表4 各组瘤胃样本的OUT数目、丰富度和多样性指数》

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《海带粉对饲喂高精料饲粮奶牛瘤胃发酵参数和菌群结构的影响》

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α多样性分析可反映微生物群落的丰富度和多样性，α多样性指数中其中反映群落丰富度是Chao1、ACE和Sobs指数，反映群落多样性的是Shannon和Simpson指数，反映测序深度是覆盖度（Good’s coverage）。由表4可知，在OTU数目和覆盖度方面各组之间差异不显著（P>0.05），表明测序深度在各组之间是可比较的。就精料水平而言，与45%低精料饲粮相比，55%高精料饲粮显著升高了Simpson指数（P<0.05），但显著降低了Shannon指数（P<0.05），对其他α多样性指数无显著影响（P>0.05）；相比55%高精料饲粮，在55%高精料饲粮中添加5%海带粉同样显著升高了Simpson指数（P<0.05），显著降低了Shannon指数（P<0.05），对其他α多样性指数无显著影响（P>0.05）。选用相似水平为97%的OUT分类学水平进行物种Venn图分析，用于统计3个组所共有和独有的OTU数目，从图1中可以直观看出，3组样本的OUT重叠较高，55%高精料饲粮组样本OUT数目比45%低精料饲粮组OUT数目增加，而55%高精料饲粮中添加5%海带粉后，OUT数目尤其是特有的OUT数目降低。基于样本OTU水平偏最小二乘判别分析（PLS-DA）对3个组的样本进行比较，主坐标分析（PCoA）图（图2）显示，3组样本明显分离，主成分1（PC1）和主成分2（PC2）在样品差异性贡献率上分别为16.06%和6.84%。进一步的ANOSIM分析显示海带粉的添加对饲喂55%高精料饲粮奶牛瘤胃细菌群落结构的影响显著（R2=0.432，P=0.011）。