《表1 土壤样本的细菌群落丰富度和多样性指数》

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《泰山不同海拔土壤的细菌多样性初步分析》


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注:表中数值为样本3个生物学重复的平均值。

Alpha多样性可用来表示每个样本群落的细菌多样性和丰富度。常用指数有Chao1指数[14]、ACE指数[15]、Shannon指数[16]和Simpson指数[17]。Chao1指数和ACE指数侧重于体现群落丰富度;Shannon指数和Simpson指数兼顾群落均匀度,均与群落多样性呈正比。为了比较不同样本的Alpha多样性,首先对OTU丰度矩阵中的全体样本统一进行随机重抽样,从而校正测序深度引起的多样性差异;随后,使用QIIME软件分别对每个样本计算多样性指数,分析结果见表1。T260的Simpson指数、Shannon指数、Chao1指数和ACE指数均最大,明显高于T850和T1500,即样本组T260的土壤细菌群落丰富度和多样性最高。T850的Simpson指数和Shannon指数略高于T1500,Chao1指数和ACE指数低于T1500,说明T850比T1500的土壤细菌群落多样性略高,但细菌的丰富度较低。