《表1 BSV-YN和10种同属病毒信息》
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《香蕉条斑病毒ORF Ⅰ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析》
BSV-YN ORFⅠ测序结果经ChromasPro软件进行序列编辑和拼接后,将其核苷酸和编码氨基酸序列经NCBI中的Blastn和Blastp分别进行搜索比对,下载相似性较高的10种同属病毒ORFⅠs的核苷酸和编码氨基酸序列(表1),再经BioEdit和GeneDoc软件对其及同源物的氨基酸序列分别进行联配和序列相似性分析。利用MEGA 6.0软件的最大似然法(Maximum Likelihood Method)构建系统发育树,分析BSV-YN ORFⅠ和其他10种同源ORFⅠs的亲缘关系。
图表编号 | XD0051348100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.10 |
作者 | 黎维丽、余乃通、李俊成、王健华、李宾宾、刘志昕 |
绘制单位 | 海南大学热带农林学院、中国热带农业科学院热带生物技术研究所·海南省微生物学重点实验室·农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室、中国热带农业科学院热带生物技术研究所·海南省微生物学重点实验室·农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室、广东省农业科学院果树研究所·广东省热带亚热带果树研究重点实验室、海南大学热带农林学院、海南大学热带农林学院、中国热带农业科学院热带生物技术研究所·海南省微生物学重点实验室·农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室、中国热带农业科学院热带生物技术研究所· |
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