《表5 甘蓝型油菜, 白菜和甘蓝PDF1.1结构的结构域》

《表5 甘蓝型油菜, 白菜和甘蓝PDF1.1结构的结构域》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《"芸薹属物种(B.napus,B.rapa,B.oleracea)防御素基因PDF1.1的生物信息学分析"》


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经SAMRT(http://smart.embl-heidel-berg.de/)搜索发现,拟南芥和芸薹属物种PDF1.1均具有Knot1结构域,该结构域代表植物凝集素或者抗菌肽,植物蛋白酶或者淀粉酶抑制剂,植物-硫蛋白和节肢动物防御素,它们被称为knottins或胱氨酸结肽,由小的抑制剂、毒素和凝集素组成(郑小敏等,2015)。并且他们的结构域大多从32号位置开始,到80号位置结束。并由TMHMM v2.0程序检测到,9个PDF1.1均有跨膜域,区域都从4号位置开始,到21号位置结束(表5)。