《表1 K-mer分析数据统计》

《表1 K-mer分析数据统计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《基于流式细胞术和K-mer分析的好好芭基因组大小估测》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

使用好好芭样本100Gb的数据用于17-mer、19-mer、21-mer分析,其频率分布如图2.横坐标表示K-mer出现的次数,纵坐标表示出现的频率.图2显示,K-mer分布曲线成峰情况较好,K-mer分布曲线为非正常泊松分布,呈现双峰分布,在64和125处各有一个峰值.根据表1中k-mer num和k-mer depth结合计算式(基因组大小为K-mer的总数与K-mer的期望深度的比值)可以估计相应的基因组大小.推测125附近为主峰,64处位置为杂合峰,得到好好芭基因组大小约为792.87、777、794Mb.