《表1 K-mer分析数据统计》
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《基于流式细胞术和K-mer分析的好好芭基因组大小估测》
使用好好芭样本100Gb的数据用于17-mer、19-mer、21-mer分析,其频率分布如图2.横坐标表示K-mer出现的次数,纵坐标表示出现的频率.图2显示,K-mer分布曲线成峰情况较好,K-mer分布曲线为非正常泊松分布,呈现双峰分布,在64和125处各有一个峰值.根据表1中k-mer num和k-mer depth结合计算式(基因组大小为K-mer的总数与K-mer的期望深度的比值)可以估计相应的基因组大小.推测125附近为主峰,64处位置为杂合峰,得到好好芭基因组大小约为792.87、777、794Mb.
图表编号 | XD004571300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.12.01 |
作者 | 马鹏举、周佳熠、孙会改、马丹丹、高飞、周宜君、张根发 |
绘制单位 | 中央民族大学生命与环境科学学院、北京师范大学生命科学学院抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室、中央民族大学生命与环境科学学院、中央民族大学生命与环境科学学院、中央民族大学生命与环境科学学院、中央民族大学生命与环境科学学院、中央民族大学生命与环境科学学院、北京师范大学生命科学学院抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |