《表2 GapsMis、needle、GapsMis-adapt算法的比对精确度》

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《时空高效的允许插入空位的short-read比对》

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许多自然过程导致DNA序列中产生gaps，精确识别gap是疾病研究的基础.我们通过模拟长度分别为50bp、100bp、150bp、200bp、250bp、300bp的查询序列，使用误配发生频率和3种不同的gap出现频率构造参考序列，并进行实验.算法needle（gop，gep）带有参数gop和gep.算法GapsM is-adapt以及算法GapsM is和needle的比对精确度如表2所示.