《表2 光合作用相关差异表达蛋白》

《表2 光合作用相关差异表达蛋白》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于iTRAQ技术的甘蔗受黑穗病菌侵染蛋白组分析》


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GO富集和KEGG富集结果显示,2个甘蔗品种均在光合作用代谢过程差异蛋白最多、差异最显著,因此,我们重点关注了与此相关的差异表达蛋白。光合作用4个多亚基蛋白复合体分别为光系统I(PS I)、光系统II(PSII)、ATP合成酶(ATPase)及细胞色素b6f复合体(Cytb6f)[20]。PS I由天线系统、反应中心、外周蛋白、内在蛋白构成,PS II主要由外周天线、内周天线、反应中心、放氧复合体和辅助亚基构成[21]。由表2可知,GT29鉴定到28个相关差异蛋白,26个上调表达,2个下调表达;Yacheng 71-374鉴定到16个相关差异蛋白,12个上调表达,4个下调表达。PSI反应中心亚基在GT29中有4个(c54318_g1;orf1、c69501_g1;orf1、c56023_g1;orf1、c56941_g1;orf1)均为上调表达,在Yacheng 71-374中有5个(c54318_g1;orf1、c48673_g1;orf1、c43081_g1;orf1、c129327_g1;orf1、c55121_g1;orf1)同样都上调表达;铁氧还蛋白[2Fe-2S]为PSI反应中心电子受体[22],在GT29下调表达,Yacheng 71-374无差异;PSI组装蛋白ycf4在GT29上调表达,Yacheng 71-374下调表达;叶绿素a-b结合蛋白由Lhca基因家族编码,为PSI天线系统[23],在GT29有11个差异表达,其中仅有1个下调表达,在Yacheng 71-374有4个差异表达,其中1个下调表达。PSII反应中心相关蛋白[21]在GT29中PSII蛋白D1、PSII蛋白D2、细胞色素b559亚基α均上调表达,在Yacheng 71-374仅细胞色素b559亚基α(c54219_g1;orf2)差异下调;内周天线蛋白PSII CP43脱辅基蛋白(c77580_g1;orf1)在GT29上调表达,Yacheng 71-374中无差异;放氧增强蛋白是PSII的放氧复合体的一部分[24],结果显示,GT29中有1个上调表达,Yacheng 71-374有2个上调表达;PSII PsbR、PSII 47 kDa蛋白在GT29上调表达,在Yacheng 71-374中无差异。细胞色素b6f复合体连接PSI和PSII中电子传递,同时促进ATP合成。GT29中细胞色素b6、细胞色素f上调表达,而在Yacheng 71-374中均无差异。ATP合成酶在GT29中一个上调表达一个下调表达,在Yacheng71-374中均无差异。还有叶绿体Ptr-ToxA结合蛋白在GT29上调表达,铜蛋白在Yacheng 71-374上调表达,16 kDa膜蛋白在GT29上调表达,而在Yacheng 71-374下调表达。结果表明,相关差异蛋白参与光合作用的多个方面,可能在2个甘蔗品种抗黑穗病过程均起重要作用,在抗病品种GT29中表现更加突出。