《表1 铁皮石斛基因组特征》

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《铁皮石斛分子遗传学和多组学研究进展》

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但Yan等[62]报道的铁皮石斛的基因组序列，有着高度分散的装配，K-mer分析中存在多个峰，表明其序列可能源自人造杂种，这复杂化了铁皮石斛基因组的正确解读。Zhang等[64]于2016年对石生兰花——铁皮石斛（Dendrobium catenatum）基因组序列进行了报道。这两篇报道的研究对象均为铁皮石斛（表1），只是在学名叫法上有争议，后者认为铁皮石斛的学名应为Dendrobium catenatum Lindl.[65]，对于铁皮石斛的拉丁学名问题，有必要进一步商榷，本文暂不做过多探讨。Zhang等[64]研究发现铁皮石斛与蝴蝶兰（Phalaenopsis）拥有几乎相同的基因数，共享全基因组重复，为二倍体，基因组大小1.01 Gb，含有38条染色体，共预测到28 910个蛋白编码基因。分析发现铁皮石斛基因组中有许多抗性相关基因发生了扩张，表明其具有一个用以适应广泛生态位的强大免疫系统。涉及葡甘聚糖合酶活性基因的大量重复，可能与药用多糖的合成相关。参与调控发育和生长的MADS-box基因clades ANR1、StMADS11和MIKC*均有不同程度扩张，表明这些扩张可能与石斛属植物形态具有高度的多样性有关。相反，I型MADS-box基因家族的基因缺失，可能解释了种子胚乳的丧失。与其他植物基因组相比，铁皮石斛拥有更多的长基因和许多独特的重复。长末端重复序列（Long rerminal repeats，LTRs）占大约基因组的46%，通过计算它们的插入次数，发现铁皮石斛在过去的500万年中出现了一系列LTR活性，因此推断这些LTR是从蝴蝶兰属的物种中被插入到铁皮石斛基因组中的。