《表1 SNP分布情况:蒙古羊不同尾椎数相关选择信号的挖掘研究》

《表1 SNP分布情况:蒙古羊不同尾椎数相关选择信号的挖掘研究》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《蒙古羊不同尾椎数相关选择信号的挖掘研究》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录
注:upstream:基因上游1 kb区域;exonic:变异位于外显子区域;intronic:变异位于内含子区域;splicing:变异位于剪接位点(内含子中靠近外显子/内含子边界的2bp);downstream:基因下游1 kb区域;intergenic:变异位于基因间区。

该研究对28只蒙古羊进行全基因组重测序,样本平均有效测序深度达到6×(绵羊基因组大小为2.6 Gb),测序质量较高(Q20=96.31%,Q30=91.71%),GC分布正常,GC含量为44.38%,对基因组的覆盖度均大于99%。通过GATK和samtools软件共同分析得到可靠SNP数量为29 926 218,Indels数量为3 755 604。SNP的分布情况见表1,其主要分布在基因间区和内含子区。