《表4 卵巢发育相关代谢通路注释统计Tab.4 The Pathways involved in ovary development of M.rosenbergii》
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《罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)卵巢发育不同时期转录组分析》
KEGG是基因组破译方面的公共数据库,该数据库从分子水平信息,尤其是大型分子数据集生成的基因组测序和其他高通量实验技术的实用程序数据库资源中系统分析基因功能、联系基因组信息和功能信息的大型知识库。通过KEGG通路注释,罗氏沼虾卵巢发育4个时期共有8423(8.83%)条unigenes被注释,共涉及184种代谢途径,基因数量排名前20位的KEGG途径如图5所显示,其中unigenes数量最多的为核糖体(ribosome)(308条,3.66%) ,其余依次为RNA转运(RNA transport)(171条,2.03%) 、帕金森氏病(Parkinson’s disease)(165条,1.96%) 、溶酶体(Lysosome)(156条,1.85%) 、吞噬体(Phagosome)(151条,1.79%) 等,参与基因数最少的为钙离子信号通路(calcium signaling pathway)(94条,1.12%) 。在184个代谢通路中,有7个代谢通路可能与卵巢发育相关(表4),分别为视黄醇代谢(Retinol metabolism)、孕酮介导卵母细胞成熟(Progesterone-mediated oocyte maturation)、胰岛素信号转导(Insulin signaling pathway)、细胞周期(Cell cycle)、Wnt信号通路(Wnt signaling pathway)、卵巢类固醇激素分泌(Ovarian steroidogenesis)、m TOR信号通路(m TOR signaling pathway)。
图表编号 | XD0034438500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.03.01 |
作者 | 陈雪峰、王春琳、顾志敏、徐宾朋、张宇飞、慎佩晶、程海华、彭菲、李喜莲、黄振远 |
绘制单位 | 宁波大学海洋学院、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、宁波大学海洋学院、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所 |
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