《表1 miR-203在TargetScanHuman、miRTarBase和mirRDB数据库中的重叠靶基因》
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《生物信息学分析miR-203与VEGFA相互作用在胎盘发育中的意义》
为确定miR‐203的靶标基因,通过对不同microR‐NA靶向数据库中的靶向基因进行预测并筛选出其中重叠的基因,确定相对更加可靠的目标基因。现选取microRNA靶向数据库TargetScanHuman、miRTarBase及mirRDB,最终分别预测出miR‐203的靶标基因为953、311及711个。运用Draw Venn Diagram分别对TargetScanHuman、miRTarBase及mirRDB中的元素进行比较,筛选3个数据库均有重叠的特殊基因其38个(图2A和表1)。最后在Cyto‐scape中构建miR‐203与38个重叠靶向基因的互作图(图2B)。
图表编号 | XD0033121200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.15 |
作者 | 汪虹、刘福林 |
绘制单位 | 武汉大学中南医院妇产科、武汉大学中南医院妇产科 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |