《表2 AY-China与其他植原体的16S rDNA核苷酸序列同源性》

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《基于高通量测序鉴定慈姑黄化病病原》

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根据获得的植原体16S rRNA序列信息设计并合成引物（Phy-F:5'-CCCAATACGAAGAGTTTGAT CCT-3'和Phy-R:5'-GGATACCTTGTTACGACTTAAC C-3'，预期PCR产物大小为1504 bp），经PCR检测发现植原体检测引物在所采集的慈姑黄化病DNA样品中均能扩增出与预期结果相符的特异性目的片段，而在无症状样品中未扩增出目的片段（图2）。对扩增获得的特异性目的片段进行克隆及序列测定，序列相似性分析结果表明，该株系与植原体16SrI组中各植原体的核苷酸序列相似性均在98.6%以上，其中与翠菊黄化植原体16SrI-B亚组（Aster yellows subgroup，16SrI-B亚组）的小茴香黄化植原体DfY-1菌株（GenBank登录号DQ381534）的核苷酸序列相似性最高，达99.5%；与其他16Sr组的核苷酸序列相似性在88.3%～96.0%（表2）。因此，黄化慈姑植株中存在的植原体属于翠菊黄化植原体16SrI-B亚组。将此植原体暂命名为慈姑黄化植原体中国分离物（Strain:AY-China；GenBank Accession No.MH428835.1）。