《表2 梅花鹿SRY基因的碱基组成与片段长度》
将测序所获序列与NCBI中序列进行BLAST比对,同源性较高,说明序列准确可靠。测得的序列经BioEdit校对后,人工去掉两端误读序列及插入/缺失,截取有效序列1 613bp,利用Mega 6.0比对,计算平均碱基含量及片段长度,结果见表2。由表2可知,梅花鹿5个亚种的碱基组成相似,同源性较高,A+T碱基含量明显高于G+C碱基含量(33.10%),说明梅花鹿SRY基因片段存在AT碱基偏好性。利用Mega 6.0比对序列,在第47、62、602、1 148、1 569、1 604bp处共检测到6个核苷酸变异位点,占核苷酸总数的0.3%,其中第47bp处出现A-G互换,第62、1 569bp处出现A-T颠换,第602、1 148、1 604bp处出现C-T互换,转换与颠换比(Ti/Tv)为2,表明SRY基因片段的碱基替换以碱基转换为主。
图表编号 | XD0032312200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.20 |
作者 | 董依萌、刘华淼、玉手英利、刘汇涛、鞠妍、邢秀梅、何金明、鞠贵春 |
绘制单位 | 吉林农业大学、中国农业科学院特产研究所、日本山形大学、中国农业科学院特产研究所、中国农业科学院特产研究所、中国农业科学院特产研究所、吉林农业大学、吉林农业大学 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |