《表2 梅花鹿SRY基因的碱基组成与片段长度》

《表2 梅花鹿SRY基因的碱基组成与片段长度》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于SRY基因分析梅花鹿的遗传多样性及父系类型》


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将测序所获序列与NCBI中序列进行BLAST比对,同源性较高,说明序列准确可靠。测得的序列经BioEdit校对后,人工去掉两端误读序列及插入/缺失,截取有效序列1 613bp,利用Mega 6.0比对,计算平均碱基含量及片段长度,结果见表2。由表2可知,梅花鹿5个亚种的碱基组成相似,同源性较高,A+T碱基含量明显高于G+C碱基含量(33.10%),说明梅花鹿SRY基因片段存在AT碱基偏好性。利用Mega 6.0比对序列,在第47、62、602、1 148、1 569、1 604bp处共检测到6个核苷酸变异位点,占核苷酸总数的0.3%,其中第47bp处出现A-G互换,第62、1 569bp处出现A-T颠换,第602、1 148、1 604bp处出现C-T互换,转换与颠换比(Ti/Tv)为2,表明SRY基因片段的碱基替换以碱基转换为主。