《表1 主要事件的定义：基于深层语境词表示与自注意力的生物医学事件抽取》

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《基于深层语境词表示与自注意力的生物医学事件抽取》

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本文以MLEE语料集为基础进行实验，与BioNLP-ST共享任务语料集，只针对分子水平的事件抽取相比，MLEE语料集旨在抽取更广泛的病理学过程中不同层级上的生物机制，包括分子、细胞、器官甚至整个生物机体。按照BioNLP-ST共享任务的数据标注标准，有针对性地定义了16种实体与19种事件结构类型，从而进行生物医学事件抽取。MLEE语料集的19种生物事件类型分为4个大类别，分别为“Anatomical”“Planned”“Molecular”和“General”，描述了解剖、病理、分子和通用等生物过程以及治疗方面的处理过程。在各个大类下，设有一系列的精确事件类型，如血管发育（Blood vessel development）、死亡（Death）、去磷酸化（Dephosphorylation）等，每种事件涉及指定的实体类型。表1给出了MLEE语料中的19类生物医学事件的定义。本文将会对表1中定义的主要事件类型进行抽取，其中“Blood vessel development”事件类型可以没有参与要素，“Regulation”“Positive regulation”“Negative regulation”和“Planned process”事件类型的要素可以是另一事件，这4类事件为可嵌套事件。