《表2 VP2基因片段中发生置换的氨基酸》
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《南宁地区犬细小病毒VP2基因的克隆及遗传进化分析》
VP2基因长1 755bp,编码584个氨基酸,在Mega 7.0软件中将由12株试验样本毒株扩增得到的VP2基因的氨基酸推导序列与GenBank中部分具有代表性的参考毒株进行氨基酸比对分析,结果见表2。由表2可知,共发现了5个主要位点的突变,分别是第267、324、370、426、440位氨基酸处。根据与参考株的比对,其决定毒株亚型的氨基酸位点主要是第370、426、440位氨基酸。NN02、NN03、NN05、NN06、NN09、NN12毒株的变异主要表现为:370Q→R、426N→E和440A→T,与中国广西分离株CPV-GX1581存在相同的变异,为CPV-2c亚型。毒株NN01、NN07、NN11变异情况为:370Q、426D和440A(其中NN11为440T),与参考毒株India-CPV-2b-2010和JAPAN CPV 97-008相同,属于CPV-2b亚型。毒株NN04、NN08、NN10其氨基酸重要位点为:370Q、426N和440A,与中国CPV-HN1506、CPV-JS1591、CPV-ZJ1579分离株一致,属于CPV-2a亚型。由以上比对分析可知,在区分亚型时第426、440位氨基酸属于重要氨基酸位点,决定着毒株的亚型。
图表编号 | XD0022147500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.12.20 |
作者 | 徐闰、黄华旭、徐小明、李政泰、马麟、劳小香、吴显实 |
绘制单位 | 广西大学动物科学技术学院、广西大学动物科学技术学院、广西大学动物科学技术学院、广西大学动物科学技术学院、广西大学动物医院、广西大学动物医院、广西大学动物科学技术学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |