《表2 各样本有效序列数据统计》

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《海南黎家山兰酒发酵过程中的微生物多样性分析》

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使用cutadapt去除Read13'端测序引物TGGAATTCTCGGGT GCCAAGGAACTC，主要参数：-O5-m。根据PEreads之间的overlap关系使用PEAR将成对reads拼接（merge）成一条序列；根据各样本barcode序列和引物序列从拼接后数据中分割出各样本数据，并校正序列方向；使用PRINSEQ切除reads尾部质量值20以下的碱基，设置10bp的窗口，如果窗口内的平均质量值低于20，从窗口开始截去后端碱基，过滤质控后的含N序列和短序列，最终过滤掉低复杂度的序列。其结果如表2所示。