《表2 各样本细菌有效数据统计》

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《病死黑斑原鮡表皮和肠道微生物群落研究》


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对黑斑原鮡病死表皮、病死肠道、健康表皮和健康肠道中高通量测序的数据进行统计(表2,表3),4个样本总共获得了115 185条合格的16S r DNA序列,有效序列的平均长度为189 bp,健康表皮和肠道的有效OUT数量明显少于病死表皮和肠道的OUT数量,表明病死表皮和肠道中的细菌多样性显著低于健康表皮和肠道中的细菌多样性。共获得567 663条合格的18S r D-NA序列,有效序列平均长度为354 bp,和细菌的多样性统计不同,健康表皮的真菌多样性高于病死表皮,而健康肠道的真菌多样性低于病死表皮。基于Observed OTUs数,构建的稀释曲线(rarefaction curve)(图1) 。从各样品的rarefaction曲线可以看出,各样品的曲线均趋向平坦,说明测序的数据量合理。