《表1 泛癌数据集信息:基于差异代谢网络的泛癌代谢分析》

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《基于差异代谢网络的泛癌代谢分析》


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TCGA是当前泛癌研究最常用的数据库,其中存储了大量原发癌和其对应癌旁组织的基因表达数据,这些数据具有多种可选类型(COUNT、FPKM、RPKM、FPKM-UQ),除此之外,还提供了临床、甲基化信息等一系列配套数据。本工作主要基于RNA-seq基因表达数据进行研究,从TCGA数据库下载了同时包含癌症组织样本和癌旁组织样本的17种癌症数据,均为原始COUNT格式,数据详情见表1。