《表1 高压灭菌培养基分离细菌鉴定信息》
本研究共获得123个16S r RNA基因序列,其长度范围是1 336~1 436 bp,平均序列长度是1 400 bp。将测序获得的16S r RNA基因序列与Ez Bio Cloud数据库模式菌株进行比对,获得其分类信息。如表1和表2所示,123株细菌分别属于放线菌门(Actinobac?teria)(58株,47.2%),厚壁菌门(Firmicutes)(48株,39.0%),变形菌门(Proteobacteria)(13株,10.6%)和拟杆菌门(Bacteroidetes)(4株,3.2%)。在科分类水平上,123株细菌涵盖15个科,优势科包括芽胞杆菌科(Bacillaceae,46株,37.4%)、脱醌菌科(Deme?quinaceae,19株,15.4%)、原小单孢菌科(Promicro?monosporaceae,15株,12.2%)和微杆菌科(Microbac?teriaceae,14株,11.4%)。在属分类水平上,涵盖了22个属,优势属包括芽胞杆菌属(Bacillus,32株,24.2%)、脱醌菌属(Demequina,19株,14.4%)和白蚁菌属(Isoptericola,15株,11.4%)。在种分类水平上,其包括45个种,优势种为稻壳芽胞杆菌(Bacillus oryzaecorticis,19株,14.4%)和嘉义白蚁菌(Isoptericola chiayiensis,15株,11.4%)。123株细菌中,共有22株细菌(AS对应的7株细菌和FS对应的15株细菌)与最近缘模式菌株的16S r RNA基因序列相似度低于98.65%,为潜在新种。
图表编号 | XD00219030700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.30 |
作者 | 刘阳、裴韬、杜娟、邓名荣、朱红惠 |
绘制单位 | 广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室、广东省菌种保藏与应用重点实验室、广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室、广东省菌种保藏与应用重点实验室、广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室、广东省菌种保藏与应用重点实验室、广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室、广东省菌种保藏与应用重点实验室、广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室、广东省菌种保藏与应用重点实验室 |
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